You are viewing the site in preview mode

Skip to main content

Table 3 Correlation analysis between CDK1, HMMR, PTTG1, and TTK and related immune markers in immune cells, as evaluated using TIMER

From: Identification of hub genes associated with prognosis, diagnosis, immune infiltration and therapeutic drug in liver cancer by integrated analysis

Description Gene marker CDK1 HMMR PTTG1 TTK
Cor P Cor P Cor P Cor P
CD8+ T cell CD8A 0.198 *** 0.139 ** 0.164 ** 0.188 ***
CD8B 0.184 *** 0.096 0.064 0.226 *** 0.165 **
T cell (general) CD3D 0.274 *** 0.154 ** 0.333 *** 0.266 ***
CD3E 0.202 *** 0.120 * 0.175 *** 0.195 ***
CD2 0.216 *** 0.121 * 0.204 *** 0.204 ***
B cell CD19 0.273 *** 0.204 *** 0.247 *** 0.273 ***
CD79A 0.158 ** 0.065 0.212 0.116 * 0.177 ***
Monocyte CD86 0.284 *** 0.266 *** 0.250 *** 0.283 ***
CD115 0.131 * 0.138 ** 0.102 * 0.119 *
TAM CCL2 0.039 0.459 0.023 0.656 − 0.023 0.665 0.021 0.682
CD68 0.230 *** 0.186 *** 0.149 * 0.204 ***
IL10 0.219 *** 0.223 *** 0.156 * 0.235 ***
M1 macrophage NOS2 − 0.020 0.695 0.080 0.123 − 0.140 ** − 0.005 0.926
IRF5 0.394 *** 0.407 *** 0.291 *** 0.373 ***
COX2 0.101 0.053 0.071 0.171 − 0.025 0.637 0.094 0.070
M2 Macrophage CD163 0.067 0.197 0.153 ** − 0.022 0.676 0.073 0.160
VSIG4 0.080 0.123 0.138 ** 0.024 0.647 0.059 0.255
MS4A4A 0.089 0.086 0.142 ** 0.027 0.601 0.079 0.128
Neutrophils CD66b 0.123 * 0.096 0.066 0.094 0.071 0.107 *
CD11b 0.257 *** 0.333 *** 0.237 *** 0.280 ***
CCR7 0.089 0.086 0.045 0.385 − 0.030 0.569 0.070 0.181
Natural killer cell KIR3DL1 0.010 0.843 0.068 0.189 − 0.053 0.308 0.009 0.869
KIR2DL1 − 0.035 0.500 − 0.023 0.656 − 0.068 0.190 − 0.044 0.393
KIR2DS4 0.075 0.148 0.076 0.142 0.029 0.581 0.044 0.400
Dendritic cell CD11C 0.331 *** 0.310 *** 0.246 *** 0.326 ***
CD1C 0.121 * 0.066 0.204 0.041 0.434 0.104 *
NRP1 0.231 *** 0.195 *** 0.005 0.916 0.180 ***
PDL1 CD274 0.209 *** 0.334 *** 0.062 0.230 0.062 0.230
Th l STAT4 0.262 *** 0.179 *** 0.215 *** 0.246 ***
STAT1 0.372 *** 0.372 *** 0.248 *** 0.398 ***
TBX21 0.081 0.119 0.050 0.341 0.018 0.736 0.084 0.107
CD4 0.222 *** 0.232 *** 0.123 * 0.228 ***
IFNG 0.266 *** 0.219 *** 0.285 *** 0.275 ***
Th 2 GATA3 0.203 *** 0.135 ** 0.133 * 0.185 ***
STAT6 0.114 * 0.192 *** − 0.108 * 0.115 *
CXCR4 0.315 *** 0.224 *** 0.204 *** 0.292 ***
CCR4 0.206 *** 0.220 *** − 0.023 0.663 0.213 ***
Treg FOXP3 0.163 ** 0.271 *** 0.023 0.655 0.205 ***
CCR8 0.392 *** 0.418 *** 0.209 *** 0.403 ***
STAT5B 0.247 *** 0.355 *** − 0.022 0.676 0.278 ***
TGFB1 0.278 *** 0.174 *** 0.207 *** 0.253 ***
T cell exhaustion PD-1 0.330 *** 0.196 *** 0.333 *** 0.308 ***
CTLA4 0.357 *** 0.244 *** 0.384 *** 0.348 ***
LAG3 0.294 *** 0.205 *** 0.348 *** 0.318 ***
TIM-3 0.296 *** 0.281 *** 0.272 *** 0.289 ***
GZMB 0.092 0.078 0.048 0.355 0.123 * 0.065 0.212
  1. *P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.0001
Back to article page

Human Genomics

ISSN: 1479-7364